數位典藏第二期計畫之三大目標：

拓展台灣數位典藏計畫：主要目標在於「建置呈現臺灣文化、社會與自然環境之多樣性的數位內容」。

推動數位典藏人文社會經濟與產業發展計畫：本分項所擔負之任務為「促成典藏內容與技術融入教育、研究、產業與社會發展」。將採取整合性之推動策略，從「文化」（culture）、「學術」（academic）、「社會經濟」（socio-economic，或簡稱「社經」）和「教育」（education）等角度切入，厚植數位典藏國家型科技計畫之基礎，並且以兼具深度與廣度的方式，挖掘數位典藏之應用潛力，期能為我國創造數位時代的成功經驗。

數位典藏海外推展暨國際合作網路推動計畫：主要目標與任務為「推動典藏成果國際化、建立國際合作網路」。